Okrem toho, že k ostrejšiemu vzhľadu Ninja 400 prispievajú, tenké LED svetlomety (každý obsahuje stretávacie a diaľkové svetlá, ako aj LED obrysové svetlo) sú dobre viditeľné a ponúkajú výrazne zvýšený jas.

Motor Ninja 400 s objemom 399 cm3 poskytuje rovnováhu medzi výkonom a ovládateľnosťou. Motor ponúka zvýšený výkon pri všetkých otáčkach v porovnaní s jeho predchodcom, s dobrým pocitom výkonu. Hladká a predvídateľná odozva prispieva k ľahko ovládateľnému charakteru motora. Kompaktný a ľahký motor má vďaka svojej efektívnej konštrukcii veľkosť porovnateľnú s motormi s objemom 250 cm3.

Ninja 400 je vybavená sofistikovaným kokpitom s veľkým analógovým tachometrom lemovaným výstražnými svetlami na jednej strane a indikátorom zaradenej rýchlosti a multifunkčným LCD displejom na strane druhej.

Poloplávajúci predný kotúč Ninja 400, ktorý meria ø310 mm (rovnaká veľkosť disku ako na Ninja ZZR1400), ponúka istý brzdný výkon. Pevný nový hlavný valec prednej brzdy pomáha eliminovať neefektívny (voľnobežný) zdvih, čím prispieva k ovládateľnosti, zatiaľ čo starostlivo zvolené rozmery brzdových hadíc a materiál prispievajú k účinnosti bŕzd. Obsahuje najnovšiu jednotku ABS od spoločnosti Nissin, najkompaktnejšiu a najľahšiu dostupnú na trhu.

Uvoľnený "trojuholník" jazdca pojme širokú škálu veľkostí jazdcov a jazdných situácií. V porovnaní s niektorými inými modelmi (ktorých trochu extrémna jazdná pozícia ohrozuje pohodlie), zvýšená poloha rukovätí a poloha stupačiek mierne vpredu dáva jazdcovi možnosť ovládať stroj a zároveň ponúka jazdcovi pohodlie.

Zatiaľ čo výška sedadla je 785 mm, jeho štíhly dizajn poskytuje jazdcom možnosť dosiahnuť ľahko na zem.

Ohromujúci vzhľad bol vždy silnou stránkou modelov Ninja, bez ohľadu na objem. Nový Ninja 400 sa môže pochváliť futuristickým dizajnom inšpirovaným mocnou Ninjou H2. Veľkoobjemová karoséria priťahuje pozornosť a pôsobí dojmom väčšieho stroja. Tento dojem je umocnený prvotriednym dizajnom a skvelým strihom a povrchovou úpravou, ktoré sú porovnateľné so strojmi z triedy s väčším objemom.

Ninja 400 má mriežkový rám podobného dizajnu ako Ninja H2. Pokročilá analýza dynamickej tuhosti Kawasaki bola použitá na zabezpečenie optimálnej tuhosti pri nízkej hmotnosti. Motor je pevne uložený a používa sa ako namáhaný prvok. Konštrukcia rámu výrazne k nízkej pohotovostnej hmotnosti motocykla.